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Les données de collections peuvent être publiées sur Internet dans le but de faciliter l'accès aux informations : |
*Un [fournisseur de données|Fournisseur_Donnees] supportant le DiGIR permet de publier des données notamment formatées en [Darwin Core|http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/] et les rend ainsi consultables directement depuis le [portail du GBIF|http://data.gbif.org/datasets/provider/119] |
*Une première interface Web permet de procéder directement à une recherche sur les bases de données de collections en remplissant un formulaire ([exemple pour les ensiferes|http://coldb.mnhn.fr/colweb/form.do?model=ENSIFERES.wwwensiferes.wwwensiferes.wwwensiferes]) |
*Une [autre interface Web|http://coldb.mnhn.fr] permet de procéder à une recherche sur les bases de données en formulant une recherche par ajout de critères successifs |
*Des fiches [HTML|http://www.w3.org/TR/REC-html40/] présentant les spécimens sont accessibles directement par URL |
**Formées à partir des numéros d'inventaire (ex : [http://coldb.mnhn.fr/CatalogNumber/MNHN/P/P00078818]) |
"P" = Acronyme de la collection. "P00078818" le numéro d'inventaire. Pour les numéros millésimé ajouter un tiret (ie : [http://coldb.mnhn.fr/CatalogNumber/MNHN/IC/2003-1058]) |
Les données de collections sont disponibles sur Internet sous plusieurs formes : |
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**Formées à partir des noms d'espèce (ex : [http://coldb.mnhn.fr/ScientificName/Solenangis/cornuta |
]) |
*Des flux [GeoRSS|http://www.w3.org/2005/Incubator/geo/minutes/20061211.html] donnant un accès localisé aux fiches HTML des spécimens géo-référencés |
**Sont disponibles sur le même modèle en ajoutant ''GeoRSS'' après le nom de domaine (ex : [http://coldb.mnhn.fr/GeoRSS/ScientificName/Solenangis/cornuta]) |
**Permettent de localiser les éléments de collections avec des services tels que ''Google Maps'' (ex : [http://maps.google.com/?q=http://coldb.mnhn.fr/GeoRSS/ScientificName/Solenangis/cornuta]) |
*Par ailleurs un [autre fournisseur de données|Publication_ABCD], a été mis en place en 2009 pour respecter le standard européen [ABCD|http://www.tdwg.org/activities/abcd/] |
* Toutes les données sont indexées et peuvent être recherchées sur [http://coldb.mnhn.fr] |
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!! Page de détail d'un item de collections |
À chaque spécimen correspond une URI formée à partir du numéro d'inventaire permettant de l'identifier |
* exemple : [http://coldb.mnhn.fr/catalognumber/mnhn/p/p00078818]) |
** où "p" = Acronyme de la collection*** et "p00078818" le numéro d'inventaire. |
** Pour les numéros millésimés ajouter un tiret : [http://coldb.mnhn.fr/catalognumber/mnhn/ic/2003-1058] |
* Sur Internet ces URI redirigent vers |
** Une fiche [HTML|http://www.w3.org/TR/REC-html40/] présentant le spécimen quand elle est accédé par un être humain dans un navigateur |
** Une ressource [RDF|http://www.w3.org/RDF/] quand elle est accédée par un agent du [web des données|http://fr.wikipedia.org/wiki/Web_des_donn%C3%A9es] |
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!! Page de détail d'un nom taxonomique |
À chaque nom taxonomique de rang générique ou spécifique correspond une page formée à partir des termes latins : |
*Exemple pour l'espèce ''Aurelia philippei'' : [https://science.mnhn.fr/taxon/species/aurelia/philippei] |
*[Documentation détaillée du contenu de la page|Internet_Nom_Taxonomique] |
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This page is [available in English|Publication_Internet_en] |
!!Liste d'éléments de collections |
Une liste paginée au format HTML des items de collections peut être constituée en utilisant le segment de ''path'' {{{list}}} |
*Exemple pour l'ensemble des spécimens de malacologie du Muséum de Paris : [https://science.mnhn.fr/institution/mnhn/collection/im/list] |
**Le segment {{{institution}}} introduit l'acronyme du Muséum de Paris (''MNHN'') |
**Le segment {{{collection}}} introduit l'acronyme des collections de malacologie à l'intérieur du Muséum de Paris (''IM'') |
*La liste peut être filtrée en utilisant des paramètres de requête. |
**Exemple pour tous les spécimens du genre ''Conus'' ayant un statut nomenclatural (ils se trouvent en malacologie ou paléontologie) : [https://science.mnhn.fr/all/list?genus=Conus&typeStatus=*] |
**Pour une liste portant sur l'ensemble des ressources exposées, faut utiliser un segment {{{all}}} en remplacement des segments d'institution et de collection |
**Attention : pour respecter les discussions tenues en MUG collections, le filtrage sur les noms taxonomiques porte sur l'ensemble de l'historique de détermination. La liste de résultats ne les présente pas toutes par souci de synthèse. |
*En ajoutant un segment ''export'', on obtient la liste au format XLS. |
**En utilisant les paramètres de matrice, il est possible de spécifier les champs indexés que l'on désire exporter. Mais il n'est ici possible d'exporter que les informations de la détermination principale, par souci de clarté. |
**Par exemple, pour obtenir l'URI du spécimen, le nom taxonomique et le statut nomenclatural de la détermination principale ainsi que les URLs des images associées : [https://science.mnhn.fr/all/list/export;URI;scientificName;scientificNameID;typeStatus;associatedMedia?genus=Conus&typeStatus=*] |
**Un paramètre de requête spécial {{{pageLength=large}}} permet d'obtenir une liste de longueur de page 5000 (et non 500). Ce paramètre est proposé dans le mode interactif exclusivement lors d'un paramétrage d'export de moins de 5000 items (dans le cas contraire un message explique la limitation). Ex : [https://science.mnhn.fr/all/list/export;URI;scientificName;scientificNameID;typeStatus;associatedMedia?genus=Conus&typeStatus=*&pageLength=large] |
*Lorsqu'on spécifie plusieurs fois le même paramètre, il s'applique avec une conjonction ''ou'' (non exclusive). C'est particulièrement intéressant pour obtenir uniquement les types porte-noms (mais du coup l'URL devient relativement complexe) : [https://science.mnhn.fr/all/list/export;URI;scientificName;scientificNameID;typeStatus;associatedMedia?genus=Conus&typeStatus=HOLOTYPE&typeStatus=LECTOTYPE&typeStatus=NEOTYPE&typeStatus=SYNTYPE&pageLength=large] |
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!!Jeux de données complets |
*Les jeux de données sont accessibles pour la plupart des collections sous forme [d'archives DarwinCore|http://code.google.com/p/gbif-ecat/wiki/DwCArchive]. Elles sont visibles à travers le [portail du GBIF|http://www.gbif.org/publisher/2cd829bb-b713-433d-99cf-64bef11e5b3e]. Ce format permet des échanges relativement légers et donc assez fréquents par le GBIF ([explications ici|Publication_Gbif_Histo]). |
**Par ailleurs un autre fournisseur de données a été mis en place lui aussi sous forme [d'archives DarwinCore|http://code.google.com/p/gbif-ecat/wiki/DwCArchive] pour [OpenUp!|http://open-up.eu/] afin d'alimenter le site [Europeana|https://www.europeana.eu/portal/fr]. |