Page de nom taxonomique#
La page de nom taxonomique exposée, refondue à l'été 2015, propose des informations issues des différentes bases de données de collections ainsi que du référentiel de l'INPN.
Elle met largement à profit les informations détaillées provenant des numérisations de types. Cette page présente par l'exemple les différents cas de figures.
Homonymies#
Homonymies dans un même code (à partir des auteurs)#
Les différents noms présentés dans une même page sont distingués par fragment d'URL sur l'autorité. Un message d'avertissement (orange) présente la situation.
- Crassula radicans
- Pelargonium anethifolium
- Phillipsastrea torreana : cas particulier illustrant bien le conditionnel - lié à un nomen nudum (c.f. S12093)
- Polyprion americanus : cas problématique où la même autorité est indiquée sous deux formes différentes
Homonymies dans deux codes différents#
Les différents noms présentés dans une même page sont distingués par fragment d'URL sur l'acronyme du code. Un message d'information (bleu) présente la situation.- Ficus (plante et mollusque)
- Oenanthe (plante et oiseau)
- Valdiviella (plante et crustacé)
- Vexillum halli (plante et mollusque)
- Ficus elegans : homonyme de code en botanique, mais aussi nom de zoologie
Entête de page du nom taxonomique#
Le nom taxonomique est identifié à partir de son binom pour l'espèce ainsi que de son autorité et de son code de nomenclature (ICN ou ICZN). Un lien vers le code en question est éventuellement associé. Une éventuelle référence est recherchée avec le référentiel de l'INPN (Taxref). À cette occasion, un nom vernaculaire en anglais ou français peut être indiqué. Si l'un des noms enregistré dans une base de collection présente une information sur la validité du nom ou un sous-genre (zoologie), cette information est aussi indiquée.
Un fenêtre d'information explique brièvement la page, elle donne la description présentée aux moteurs de recherche.
Dans la mesure du possible, une page est aussi présentée pour les noms qui n'apparaissent jamais avec une determination etatdoc='a'.
Les informations issues de l'INPN sont explicitement indiquées par infobulle ou boîte d'information. Une section dédiée indique la référence précise et donne un lien si possible.
- Nom vernaculaire et références INPN : Coffea arabica
- Sous-genre et aucun etatdoc='a' : Rana ridibunda
- Nomen nudum : Chactas bonito
Dans le cas du nom générique, l'autorité n'étant pas enregistrée dans les bases de données de collection, une autorité disponible dans Taxref est indiquée.
Révisions, noms associés, références bibliographiques#
Si des types sont identifiés dans les bases de données de collections, les éventuelles révisions du nom et les autres noms associés sont présentés à partir de l'historique de détermination des spécimens. Les révisions sont identifiées à partir de l'épithète spécifique et de l'autorité. Un boîte d'information indique quand l'une des "révisions" est à priori celle utilisée dans la description originale. Les références bibliographiques sont détaillées pour le nom ainsi que ses révisions (quand il s'agit d'une révision, c'est indiqué - une boîte d'information explique brièvement aux utilisateurs).- Référence uniquement sur une révision : Aurelia philippei
- Nombreuses combinaisons : Trochosmilia faujasi
- Nombreuses combinaisons : Ovula gisortiana
Localité type et Barcoding moléculaire#
Références externes#
Des références externes sont associées en fonction de la répartition de l'espèce dans les collections.- Botanique : Rosa gallica
- Invertébrés marins : Tropocyclops piscinalis
- Ichtyologie : Rhyacichthys guilberti
- Hémiptères : Podoschtroumpfa magna
Types et images#
Les types éventuellement disponibles sont identifiés pour le nom présenté (uniquement dans la page d'espèce). En zoologie, le type porte-nom est explicitement désigné. La série typique est aussi identifiée lorsque c'est possible. En botanique, une liste unique est constituée en raison des isotypes : les types porte-noms y apparaissent en premier. Les images des spécimens types sont présentées en carrousel lorsqu'elles sont disponibles mais seuls les spécimens sont consultables.- Holotype et paratypes, sans images (ICZN) Garthambrus abyssicolus
- Holotype et allotypes, avec images (ICZN) : Acronomastax butticerca
- Holotype, série typique et autres, avec images (ICZN) : Bythograea galapagensis
- Lectotype et isolectotypes (ICN) : Eugenia rubiginosa
- Lectotype, isosyntype et paratype (ICN) : Balardia platensis
Taxonomie#
Les classifications des noms taxonomiques sont obtenues par regroupement. Ceux-ci ne sont effectués que sur etatdoc='a'. La plupart du temps, ces regroupements convergent. Dans certains cas, ils divergent. Dans ce cas-là, la divergence est indiquée par un encadré rouge : la situation est détaillée par infobulle.- Divergence de famille : Centroscymnus coelolepsis
Noms de rang inférieur#
Les noms de rang inférieur sont indiqués. Pour les noms de rang générique, il est fréquent que la liste soit longue. Dans ce cas-là, seuls les premiers noms sont présentés par défaut pour alléger la présentation. Un bouton permet d'obtenir la liste complète.- Nom générique (noms spécifiques indiqués) : Tamarix
- Nom spécifique (noms infra-spécifiques indiqués) : Coffea canephora
Répartition dans les collections#
La répartition du nom dans les collections est détaillée dans un tableau. Celle-ci n'est effectuée que sur etatdoc='a'.Cas susceptibles de poser problème#
Le nom pourrait poser problème s'il n'est pas enregistré de manière complète (ou de manière erronée).
- Parioglosus galzini
- Rana rostandi
- Coffea bertrandi (à la place de Coffea bertrandii)
Le nom peut éventuellement poser problème s'il n'est associé qu'à des déterminations dont aucune ne vaut ETATDOC='a'. En effet, dans ce cas-là, le détail des spécimens n'est chargé que s'il y a des types enregistrés.
- Nom non détaillé (synonyme ICZN) : Agathis, pour comprendre, il y a un seul spécimen avec détermination 'd' mais elle n'a pas de statut.
- Nom détaillé par spécimen avec statut : Gisortia gisortiensis, il y a un seul spécimen avec détermination 'd' mais elle a un statut.
Le nom peut aussi poser problème si l'on n'est pas en mesure de déterminer son code de nomenclature.
Pour deux espèces de foraminifères :
- Triloculina cretacea est correctement détaillée puisque le groupe associé au lot est celui des invertébrés
- Triloculina dubia n'est pas du tout détaillée puisque le groupe associé au lot est celui de la micropaléontologie (ce qui est dommage puisqu'il s'agit d'un Syntype que d'Orbigny a étudié)
Le problème spécifique à la micropaléontologie fait l'objet d'une réflexion puisque le résultat peut s'avérer gênant vis-à-vis du public.