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Publication sur Internet#
Les données de collections sont disponibles sur Internet sous plusieurs formes :
- Toutes les données sont indexées et peuvent être recherchées sur http://coldb.mnhn.fr
Page de détail d'un item de collections#
À chaque spécimen correspond une URI formée à partir du numéro d'inventaire permettant de l'identifier- exemple : http://coldb.mnhn.fr/catalognumber/mnhn/p/p00078818
)
- où "p" = Acronyme de la collection*** et "p00078818" le numéro d'inventaire.
- Pour les numéros millésimés ajouter un tiret : http://coldb.mnhn.fr/catalognumber/mnhn/ic/2003-1058
- Sur Internet ces URI redirigent vers
- Une fiche HTML
présentant le spécimen quand elle est accédé par un être humain dans un navigateur
- Une ressource RDF
quand elle est accédée par un agent du web des données
- Une fiche HTML
Page de détail d'un nom taxonomique#
À chaque nom taxonomique de rang générique ou spécifique correspond une page formée à partir des termes latins :- Exemple pour l'espèce Aurelia philippei : https://science.mnhn.fr/taxon/species/aurelia/philippei
- Documentation détaillée du contenu de la page
Liste d'éléments de collections#
Une liste paginée au format HTML des items de collections peut être constituée en utilisant le segment de path list- Exemple pour l'ensemble des spécimens de malacologie du Muséum de Paris : https://science.mnhn.fr/institution/mnhn/collection/im/list
- Le segment institution introduit l'acronyme du Muséum de Paris (MNHN)
- Le segment collection introduit l'acronyme des collections de malacologie à l'intérieur du Muséum de Paris (IM)
- La liste peut être filtrée en utilisant des paramètres de requête.
- Exemple pour tous les spécimens du genre Conus ayant un statut nomenclatural (ils se trouvent en malacologie ou paléontologie) : https://science.mnhn.fr/all/list?genus=Conus&typeStatus=*
- Pour une liste portant sur l'ensemble des ressources exposées, faut utiliser un segment all en remplacement des segments d'institution et de collection
- Attention : pour respecter les discussions tenues en MUG collections, le filtrage sur les noms taxonomiques porte sur l'ensemble de l'historique de détermination. La liste de résultats ne les présente pas toutes par souci de synthèse.
- Exemple pour tous les spécimens du genre Conus ayant un statut nomenclatural (ils se trouvent en malacologie ou paléontologie) : https://science.mnhn.fr/all/list?genus=Conus&typeStatus=*
- En ajoutant un segment export, on obtient la liste au format XLS.
- En utilisant les paramètres de matrice, il est possible de spécifier les champs indexés que l'on désire exporter. Mais il n'est ici possible d'exporter que les informations de la détermination principale, par souci de clarté.
- Par exemple, pour obtenir l'URI du spécimen, le nom taxonomique et le statut nomenclatural de la détermination principale ainsi que les URLs des images associées : https://science.mnhn.fr/all/list/export;URI;scientificName;scientificNameID;typeStatus;associatedMedia?genus=Conus&typeStatus=*
- Un paramètre de requête spécial pageLength=large permet d'obtenir une liste de longueur de page 5000 (et non 500). Ce paramètre est proposé dans le mode interactif exclusivement lors d'un paramétrage d'export de moins de 5000 items (dans le cas contraire un message explique la limitation). Ex : https://science.mnhn.fr/all/list/export;URI;scientificName;scientificNameID;typeStatus;associatedMedia?genus=Conus&typeStatus=*&pageLength=large
- Lorsqu'on spécifie plusieurs fois le même paramètre, il s'applique avec une conjonction ou (non exclusive). C'est particulièrement intéressant pour obtenir uniquement les types porte-noms (mais du coup l'URL devient relativement complexe) : https://science.mnhn.fr/all/list/export;URI;scientificName;scientificNameID;typeStatus;associatedMedia?genus=Conus&typeStatus=HOLOTYPE&typeStatus=LECTOTYPE&typeStatus=NEOTYPE&typeStatus=SYNTYPE&pageLength=large
Jeux de données complets#
- Les jeux de données sont accessibles pour la plupart des collections sous forme d'archives DarwinCore
. Elles sont visibles à travers le portail du GBIF
. Ce format permet des échanges relativement légers et donc assez fréquents par le GBIF (explications ici).
- Par ailleurs un autre fournisseur de données a été mis en place lui aussi sous forme d'archives DarwinCore
pour OpenUp!
afin d'alimenter le site Europeana
.
- Par ailleurs un autre fournisseur de données a été mis en place lui aussi sous forme d'archives DarwinCore
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